|
|
Výpočty elektronové struktury biologicky relevantních komplexů přechodných kovů
Matoušek, Mikuláš ; Veis, Libor (vedoucí práce) ; Mančal, Tomáš (oponent)
Porfyriny jsou důležitou skupinou molekul, která je intenzivně studována, jak ex- perimentálně, tak výpočetně. Ale, přes veškerou snahu, u mnoha otázek stále nejsme schopni dosáhnout konzistentní shody mezi teorií a experimentem. Jednou z dosud nevyřešených otázek je charakter základního stavu molekuly Fe(II)-porfyrinu. Použili jsme model molekuly Fe(II)-porfyrinu, na kterém jsme studovali efekt změn geometrie na pořadí spinových stavů. Pomocí rozsáhlých DMRG-CASSCF výpočtů se zahrnutím dynamické korelace metodou TCCSD(T) se nám podařilo spojit efekt těchto geomet- rických změn s experimentálními daty výsledky, a předpovědět, že izolovaná molekula Fe(II)-porfyrinu bude mít kvintetní základní stav. Navíc, s použitím koordinovaného porfyrinu, náležící do skupiny komplexů železnatého porfyrinu s karbenem, ukazujeme, že i geometrické změny mimo porfyrinové jádro nemohou být přehlíženy. 1
|
|
|
Multireference coupled cluster methods with local pair natural orbital approach
Lang, Jakub ; Pittner, Jiří (vedoucí práce) ; Neogrady, Pavel (oponent) ; Musial, Monika (oponent)
Multireferenční metody spřažených klastrů (MRCC) jsou přesným nástrojem pro popis kvazidegenerovaných systémů, kde hraje důležitou roli statická korelace. Bohužel dosavadní implementace byly použitelné jen pro malé molekuly. Ale ukázalo se, že metoda doménových lokálních přirozených párových orbitalů dokáže tento problém vyřešit a je možné pomocí ní spočítat mnohem větší molekuly. Nově vyvinuté DLPNO-MkCCSD, DLPNO-TCCSD a DLPNO- MkCCSD(T) metody jsou schopné získat více než 99.7% kanonické korelační energie a popsat systémy s víc než 2000 bázovými funkcemi na jedno-jádrovém procesoru za několik hodin. Kromě toho jsme vyvinuli tailored variantu MRCC a úspěšně ji použili pro excitované stavy cyklobutadienu, kde tradiční MRCC selhává.
|
host ::
RSS.